公元8世紀(jì)，唐天寶年間，于闐古代維吾爾名醫(yī)比吉·贊巴·希拉汗應(yīng)聘入西藏，擔(dān)任王室侍醫(yī)，曾將自己所著《醫(yī)學(xué)寶鑒》《傷寒解義》《尸體圖覽》《甘露寶鑒》等10余種醫(yī)書譯成藏文獻給藏王。藏王赤德祖贊(704～754年在位)令人將書集中收藏，統(tǒng)一命名為《王室養(yǎng)生保健全書》。吐蕃王朝第五代藏王赤松德贊(754～797年在位)即位后，繼續(xù)以重金延聘各國名醫(yī)入藏傳授醫(yī)術(shù)，編譯醫(yī)藥著作，發(fā)展藏醫(yī)藥學(xué)。希拉汗曾與他人合寫《漢地脈診妙法》《消腫神方》《放血鐵蓮》《穿刺巧術(shù)》《養(yǎng)身晶珠》等30多部醫(yī)藥著作。他告老返回于闐前曾將有關(guān)人體解剖測量的書籍和包括諸論治療，切脈秘訣等內(nèi)容的醫(yī)學(xué)巨著《黃色比吉經(jīng)函》一起獻給藏王。這些維醫(yī)藥著作對后來的藏醫(yī)名著《四部醫(yī)典》的產(chǎn)生起了很大的作用。9世紀(jì)中葉后期，生活在中國漠北的維吾爾族一部回紇，由于回紇汗國遭受饑荒和疾病，經(jīng)濟瀕于崩潰，又為黠嘎斯所破，其大部分西遷，同原來就居住在新疆廣大地區(qū)操焉耆、龜茲、于闐語的回鶻融合。公元9世紀(jì)左右的《回鶻醫(yī)學(xué)文獻》是反映當(dāng)時高昌(今吐魯番)回鶻王朝醫(yī)學(xué)的珍貴資料，其內(nèi)容毛括臨床各科疾病、治療及藥方，療法包括食療、藥療、理療、冷熱敷、灸烙、放血、穿刺、清理傷口、骨折夾板固定、水療、日療及精神療法；藥物中牛角、尿、乳汁、羚羊角、斯迪系……牛、馬、狼、人和兔膽汁、麝香、海貍香、硇砂、胡楊膠、桑椹干、柴白檀香、葡萄醋、黑胡椒、芝麻、蒜和自鉛粉等。隋唐時代，古代維吾爾醫(yī)藥曾經(jīng)興盛一時，遠(yuǎn)傳至西安和東南沿海口岸。揚州是當(dāng)時的商業(yè)城市，西域的僧侶、商人也絡(luò)繹不絕來到揚州。揚州高僧鑒真和尚為到日本去傳教，因幾次渡海失敗，患眼疾失明，多方醫(yī)治無效，后來曾請到一位西域回鶻醫(yī)生給他做了手術(shù)后痊愈，重新起航去日本順利地進行傳教。由此可見，當(dāng)時維醫(yī)也有相當(dāng)高的外科手術(shù)技術(shù)。維吾爾著名科學(xué)家、哲學(xué)家、天文學(xué)家、醫(yī)學(xué)家法拉比(公元870～950年)有關(guān)醫(yī)學(xué)的著作有十幾部，有《論自然界》《論人體學(xué)》《論神經(jīng)學(xué)》《器官的功能》《論自然物的熱性、寒性、濕性、干性》等。他以四大物質(zhì)(四要素)學(xué)說論證了自然界和人體生理、病理的變化關(guān)系。這不但對推動回鶻醫(yī)學(xué)發(fā)展起了重要作用，而對他的間接學(xué)生伊本·西拿的《大醫(yī)典》，甚至阿拉伯、中亞醫(yī)學(xué)產(chǎn)生了巨大影響。

10世紀(jì)新疆處于喀拉汗王朝時期，維族開始信奉伊斯蘭教，為此新疆阿圖什設(shè)立了“麥德日斯·薩其也”(放光)學(xué)堂，它是包括醫(yī)學(xué)專科在內(nèi)的綜合性科學(xué)院校。該校最著名的維醫(yī)外科學(xué)家伊麻都丁·喀什格日是受人民尊敬的醫(yī)師，他多次奔赴戰(zhàn)場成功的完成了各種外科手術(shù)，他高超的醫(yī)技和人道主義精神，博得了國王博格拉汗的恩賜，獎給了戰(zhàn)馬和戰(zhàn)刀。他著《注大醫(yī)典》《中國菝葜》等專著。雖然，維吾爾族由于喀拉汗王朝中期開始使用阿拉伯字母的察哈臺文，許多回鶻文醫(yī)著未能保存下來，但從當(dāng)時的《福樂智慧》《突厥語大詞典》及元代以后維醫(yī)專著可驗證有關(guān)回鶻醫(yī)學(xué)大量資料。麻赫穆德·喀格里(1020～1080年)的《突厥語大詞典》中記載的臨床各科疾病，療法及處方用藥的格調(diào)與《回鶻醫(yī)學(xué)文選》一脈相承，如：“給狂犬咬傷的人，服瘋狗的腦就會好”，“對夜尿癥，用駱駝肉和大麥混做飯，食用就愈”、“若牙疼，硼砂、麝香混合放在牙上”等上百種療法及藥名。《福樂智慧》的作者優(yōu)素甫·哈斯·哈吉甫(1009～1070年)不但以長詩形式頌敘了喀拉汗王朝時期的政治、經(jīng)濟、文化繁榮發(fā)展的嶄新面貌，同時又用醫(yī)學(xué)思想闡述了人的生、老、病、死與自然界四要素(火、氣、水、土)及人體氣質(zhì)、體液(膽液質(zhì)、血液質(zhì)、粘液質(zhì)、黑膽質(zhì))的平衡有著密切的關(guān)系并介紹其治療總則及20種劑型名稱。12世紀(jì)初，西遼政權(quán)統(tǒng)治新疆至蒙古時期，和田一位著名的維醫(yī)學(xué)家阿老丁·穆罕木德·和田尼(1150 1222年)著。Zubdatul Kawanil Ilaj(治療精華)”及“Tibbi Fitki(法醫(yī))”，手抄本一直流傳至今。同一時期，維吾爾醫(yī)名醫(yī)賈馬力丁·阿克薩依出生在和田墨玉縣阿克薩依村，他以本村名命名的維醫(yī)專著《阿克薩依》于1899年在印度勒克瑙城正式出版，同時作為印度首都德里的伊斯蘭醫(yī)學(xué)院正式教材用到1929年。該書包括：維醫(yī)基礎(chǔ)理論、各科疾病及其治療、藥物及方劑等，是一部國內(nèi)外享有很高聲譽的維醫(yī)藥名著。

元代的統(tǒng)治階級為了讓更多的維吾爾(回鶻、回回、畏兀兒、哈喇魯)人參政，并滿足他們的要求，對回回醫(yī)學(xué)也很重視，在大都和上都均設(shè)回回藥物院，維藥學(xué)家答里麻在1307年(僅19歲)任該院達魯花赤(院長)，回回藥物院擴建為廣惠司后，回鶻外科醫(yī)生聶只耳是任該司的令君。據(jù)庫車17世紀(jì)維吾爾名醫(yī)《西日甫·本·佳馬力丁·阿吉傳》記載：庫車著名維醫(yī)藥學(xué)家胡都優(yōu)木汗·阿吉(1567～1658)1619年參與《回回藥方》36卷的編撰工作。據(jù)住在合州釣魚山(四川合州)縣行醫(yī)的著名軍醫(yī)赤海牙和布魯米希的兒子醫(yī)師愛薛(1247～1318年)，均是元代維吾爾名醫(yī)?！短K拉赫(明凈)》是維吾爾科學(xué)家賈馬勒·卡爾西(？～1322年)在喀什用波斯文撰寫的維醫(yī)學(xué)詞匯為主的自然、地理、氣象詞典。同一時期居住在中原的維吾爾藥學(xué)家薩德彌實有專著《瑞竹堂經(jīng)驗方》。維醫(yī)營養(yǎng)學(xué)家忽思慧撰寫的《飲膳正要》是中國古代一部飲食衛(wèi)生與營養(yǎng)學(xué)專著(關(guān)于薩德彌實和忽思慧的族別，目前尚有爭論——本書主編)。和田維吾爾名醫(yī)毛拉·阿日甫(1556～1662年)著《Dasturul Ilaj》(醫(yī)療指南)；明清時期，維醫(yī)藥學(xué)知識在漢族中醫(yī)藥著作中有了更多的反映。如：明代的《本草綱目》中記載：阿魏、茜草、硇砂、胡黃連、胡麻、胡桃、胡蔥、菠蘿、茴香、紅花、蓽茇、刺糖、膃肭臍、膃肭獸、返魂香、大尾羊、黃羊、駝、酪、醍醐、羚羊角、金、玉、瑪瑙等100多種。也有眾多維醫(yī)名醫(yī)著作問世，如：17世紀(jì)維吾爾名醫(yī)木拉德。拜克著《Agiraz Tibbi》(醫(yī)學(xué)之目的)，18世紀(jì)莎車名醫(yī)毛拉那·賽衣非的《木排日勒·庫魯比》，還有19世紀(jì)穆罕木德·熱依木·沙·布瓦的《滿百依·福瓦依》，賽依德·穆合塔爾·布拉克·拜克的《提比·西法》，霍加·熱衣木·阿洪的《提比·充》，奧斯?jié)M·拜克的《夏拉依提·斯海提》，木拉德·拜克的《塔吉日巴提·提比也》，毛拉·玉素甫的《特日庫力·依拉吉》，買買提明的《孜亞奧力·庫魯甫》及喀什名醫(yī)拜德爾丁·蘇皮·阿洪的《Xifail Kulub》(如意療法)，等等。